Διαφορά μεταξύ πλασμιδίου και κοσμιδίου

Κύρια διαφορά – Plasmid vs Cosmid

Το πλασμίδιο και το κοσμίδιο είναι δύο από τους τέσσερις τύπους φορέων που μεταφέρουν τεχνητά ξένο γενετικό υλικό σε ένα δεύτερο κύτταρο. Οι ιικοί φορείς και τα τεχνητά χρωμοσώματα είναι οι άλλοι τύποι φορέων που φέρουν ξένο DNA. Οι φορείς είναι αυτοαντιγραφόμενα, δίκλωνα μόρια DNA. Χρησιμοποιούνται ευρέως στον εργαστηριακό χειρισμό γονιδίων. Η κύρια διαφορά μεταξύ πλασμιδίου και κοσμιδίου είναι ότι το πλασμίδιο είναι ένας βρόχος δίκλωνου DNA, που βρίσκεται φυσικά στο βακτηριακό κυτταρόπλασμα και αντιγράφεται ανεξάρτητα από τα χρωμοσώματα, ενώ το κοσμίδιο είναι ένας τύπος πλασμιδίου που κατασκευάζεται με την εισαγωγή του cos αλληλουχίες από τον λ φάγο.

Βασικές περιοχές που καλύπτονται 

1. Τι είναι το πλασμίδιο
      – Χαρακτηριστικά, Δομή, Χρήσεις
2. Τι είναι ένα Cosmid
      – Χαρακτηριστικά, Δομή, Χρήσεις
3. Ποιες είναι οι ομοιότητες ανάμεσα στο Plasmid και το Cosmid
      – Κοινές λειτουργίες
4. Ποια είναι η διαφορά μεταξύ Plasmid και Cosmid
      – Σύγκριση βασικών διαφορών 

Βασικοί όροι:Διάνυσμα, πλασμίδιο, κοσμίδιο, υβριδικοί φορείς, δίκλωνο DNA, βακτήρια, τοποθεσία Cos, ένθετο

Τι είναι ένα πλασμίδιο

Τα πλασμίδια είναι εξωχρωμοσωμικά, αυτοαναπαραγόμενα, δίκλωνα, κυκλικά μόρια DNA, που βρίσκονται συνήθως σε βακτηριακά κύτταρα. Ωστόσο, τα πλασμίδια δεν είναι απαραίτητα για την επιβίωση των βακτηρίων υπό κανονικές συνθήκες. Περιέχουν τις απαραίτητες πληροφορίες για την αντοχή στα αντιβιοτικά, την αντοχή μετάλλων, τη δέσμευση αζώτου και την παραγωγή τοξινών. Τα φυσικά απαντώμενα πλασμίδια μπορούν να τροποποιηθούν με τεχνικές in vitro όπως ο μετασχηματισμός κώδικα. Τα πλασμίδια είναι τύποι φορέων που χρησιμοποιούνται ως φορείς για τη μεταφορά γενετικών πληροφοριών σε ένα δεύτερο κύτταρο.

Χαρακτηριστικά των Plasmids

• Τα πλασμίδια μπορούν να απομονωθούν εύκολα από τα κύτταρα.
• Τα πλασμίδια μπορούν να αυτοαναπαραχθούν μέσα σε ένα κύτταρο.
• Τα πλασμίδια αποτελούνται από μια μοναδική θέση περιορισμού για ένα ή περισσότερα ένζυμα περιορισμού.
• Η εισαγωγή ενός ξένου κομματιού DNA ενδέχεται να μην αλλάξει τις ιδιότητες αντιγραφής του.
• Τα πλασμίδια μπορούν να επανεισαχθούν διαδοχικά σε νέα κύτταρα και τα μετασχηματισμένα κύτταρα μπορούν να επιλεγούν.
• Τα πλασμίδια δεν υπάρχουν ελεύθερα στη φύση.

Εικόνα 1:Ένα πλασμίδιο

Τι είναι ένα Cosmid

Τα κοσμίδια είναι υβριδικοί φορείς που προέρχονται από πλασμίδια. Περιέχουν cos γονίδια του λ βακτηριοφάγου. Η παρουσία της συνεκτικής τελικής θέσης, cos λ σε ένα πλασμίδιο επιτρέπει στο πλασμίδιο να συσκευαστεί in vivo σε ιικά σωματίδια. Όμως, τα κοσμίδια δεν έχουν γονίδια που κωδικοποιούν ιικές πρωτεΐνες. Επομένως, ο σχηματισμός ιικών σωματιδίων απαγορεύεται στα κοσμίδια. Τόσο τα πλασμίδια όσο και τα κοσμίδια μοιράζονται την αρχή της αντιγραφής, ένα γονίδιο δείκτη, το οποίο κωδικοποιεί την αντίσταση στα αντιβιοτικά και μια ειδική θέση για την εισαγωγή ενός ξένου κομματιού DNA. Επιπλέον, τα κοσμίδια μπορούν να φιλοξενήσουν θραύσματα μεγέθους έως και 45 kb. Δεδομένου ότι οι φορείς κοσμιδίου είναι ικανοί να εισάγουν μεγάλα θραύσματα DNA σε σύγκριση με πλασμίδια, είναι κατάλληλοι για την κλωνοποίηση μεγάλων γονιδίων θηλαστικών ή θραυσμάτων πολλαπλών γονιδίων.

Πλεονεκτήματα των Κοσμιδίων

• Οι βιβλιοθήκες γονιδίων με μικρά μέλη κλώνων μπορούν να επεκταθούν σε ολόκληρο το γονιδίωμα με κοσμίδια.
• Ένα μεγάλο γονίδιο μπορεί να μελετηθεί άθικτο.
• Μελέτες γενετικής σύνδεσης μπορούν να πραγματοποιηθούν εύκολα.
• Η συχνότητα μετασχηματισμού αυξάνεται με τη χρήση κοσμιδίων.

Εικόνα 2:Ένα Κοσμίδιο

Ομοιότητες μεταξύ Plasmid και Cosmid

• Τα πλασμίδια και τα κοσμίδια είναι φορείς που μεταφέρουν τεχνητά ξένο γενετικό υλικό σε ένα δεύτερο κύτταρο.

• Τόσο τα πλασμίδια όσο και τα κοσμίδια είναι κυκλικά, δίκλωνα μόρια DNA.

• Και τα δύο χρησιμοποιούνται ως φορείς κλωνοποίησης στη γενετική μηχανική.

Διαφορά μεταξύ Plasmid and Cosmid

Ορισμός

Πλασμίδιο: Το πλασμίδιο είναι μια γενετική δομή στο κύτταρο που μπορεί να αναπαραχθεί ανεξάρτητα από το χρωμόσωμα.

Cosmid: Το κοσμίδιο είναι ένας τύπος υβριδικού πλασμιδίου που περιέχει λ φάγο cos ακολουθίες.

Αλληλογραφία

Πλασμίδιο: Το πλασμίδιο είναι ένας τύπος φορέα κλωνοποίησης.

Cosmid: Το Cosmid είναι ένας υβριδικός φορέας κλωνοποίησης.

Συνεκτικοί τελικοί ιστότοποι

Πλασμίδιο: Τα πλασμίδια στερούνται συνεκτικών τελικών θέσεων.

Cosmid: Τα κοσμίδια περιέχουν μια συνεκτική τελική θέση, η οποία επιτρέπει στο πλασμίδιο να συσκευαστεί σε ένα σωματίδιο ιού.

Μέγεθος του Ένθετου

Πλασμίδιο: Το πλασμίδιο μπορεί να φιλοξενήσει ένα κομμάτι DNA έως και 15 kb.

Cosmid: Τα κοσμίδια μπορούν να φιλοξενήσουν θραύσματα μεγέθους έως και 45 kb.

Συχνότητα μετασχηματισμού

Πλασμίδιο: Η συχνότητα μετασχηματισμού των πλασμιδίων είναι χαμηλή.

Cosmid: Η συχνότητα μετασχηματισμού του κοσμιδίου είναι υψηλότερη από αυτή των πλασμιδίων.

Παραδείγματα

Πλασμίδιο: Τα pBR322, pBG1805 και pYES2.1 είναι τα παραδείγματα των πλασμιδίων.

Cosmid :Το pHV79 είναι ένα από τα πιο κοινά κοσμίδια που χρησιμοποιούνται στη γενετική μηχανική.

Συμπέρασμα

Το πλασμίδιο και το κοσμίδιο είναι δύο φορείς τεχνητού DNA μεταξύ των κυττάρων. Ένα πλασμίδιο είναι ένα κυκλικό, δίκλωνο μόριο DNA, το οποίο αποτελείται από μια θέση για την εισαγωγή ενός ξένου κομματιού DNA, το οποίο πρόκειται να μετασχηματιστεί. Τα κοσμίδια είναι τροποποιημένα πλασμίδια, που περιέχουν cos θέσεις του λ βακτηριοφάγου. Λόγω της παρουσίας cos τοποθεσία, το cosmid είναι ικανό να συσκευάζεται σε ένα σωματίδιο ιού. Για το λόγο αυτό, τα κοσμίδια μπορούν να φιλοξενήσουν μεγάλα κομμάτια DNA σε σύγκριση με τα πλασμίδια. Έτσι, η κύρια διαφορά μεταξύ πλασμιδίου και κοσμιδίου βρίσκεται στη δομή τους.

Αναφορά:

1. «Χρήσιμες Σημειώσεις για 4 Κατηγορίες Φορέων (DNA οχημάτων – Πλασμίδια, Βακτηριοφάγοι, Κοσμίδια και Φασμίδια).» ΜΟΙΡΑΣΤΕΙΤΕ ΤΑ ΔΟΚΙΜΙΑ ΣΑΣ. N.p., 19 Σεπτ. 2015. Web. Διαθέσιμο εδώ. 06 Ιουνίου 2017. 
2. "Φορείς κλωνοποίησης που χρησιμοποιούνται στην τεχνολογία ανασυνδυασμένου DNA:3 φορείς κλωνοποίησης." Συζήτηση Βιολογίας. Ν.π., 16 Οκτ. 2015. Web. Διαθέσιμο εδώ. 06 Ιουνίου 2017.