Διαφορά μεταξύ προπαρασκευαστικής και αναλυτικής φυγοκέντρησης

Κύρια διαφορά – Προπαρασκευαστική έναντι αναλυτικής φυγοκέντρησης

Η φυγοκέντρηση είναι μια μέθοδος διαχωρισμού στην οποία η εφαρμογή της φυγόκεντρης δύναμης καθιζάνει ή κλασματοποιεί ένα ετερογενές μείγμα. Η μικροφυγοκέντρηση, η φυγοκέντρηση υψηλής ταχύτητας και η υπερφυγοκέντρηση είναι οι τρεις τύποι φυγοκέντρησης με βάση τον όγκο και την ταχύτητα που χρησιμοποιούνται στη διαδικασία. Μεταξύ άλλων μεθόδων φυγοκέντρησης, η υπερφυγοκέντρηση χρησιμοποιεί τη μέγιστη γωνιακή ταχύτητα. Η ταχύτητα περιστροφής της υπερφυγοκέντρησης είναι τόσο υψηλή όσο 1 000 000 g. Έτσι, η υπερφυγοκέντρηση χρησιμοποιείται για την απομόνωση μικρών σωματιδίων όπως ριβοσώματα, πρωτεΐνες και ιούς. Η προπαρασκευαστική και η αναλυτική φυγοκέντρηση είναι οι δύο τύποι μεθόδων υπερφυγοκέντρησης. Η κύρια διαφορά μεταξύ της προπαρασκευαστικής και της αναλυτικής φυγοκέντρησης είναι ότι η προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση χρησιμοποιείται για τη σφαιροποίηση μικρών υλικών όπως μεμβράνες, οργανίδια, ιοί, DNA και RNA, ενώ η αναλυτική φυγοκέντρηση χρησιμοποιείται για τον προσδιορισμό της μάζας και του σχήματος μακρομορίων όπως τα συμπλέγματα πρωτεϊνών και ο ρυθμός καθίζησης των μορίων .

Βασικές περιοχές που καλύπτονται

1. Τι είναι η Προπαρασκευαστική Φυγοκέντριση
     – Ορισμός, Γεγονότα, Χρήσεις
2. Τι είναι η αναλυτική φυγοκέντρηση
     – Ορισμός, Γεγονότα, Χρήσεις
3. Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ της προπαρασκευαστικής και της αναλυτικής φυγοκέντρησης
     – Περίληψη κοινών χαρακτηριστικών
4. Ποια είναι η διαφορά μεταξύ της προπαρασκευαστικής και της αναλυτικής φυγοκέντρισηςς
     – Σύγκριση βασικών διαφορών

Βασικοί όροι:Αναλυτική φυγοκέντρηση, αναλυτικές διεργασίες, φυγοκέντρηση με κλίση πυκνότητας, φυγόκεντρος υψηλής ταχύτητας, προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση, μικρά σωματίδια

Τι είναι η Preparative Centrifugation

Η προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση αναφέρεται σε μια φυγόκεντρο υψηλής ταχύτητας που χρησιμοποιείται για το διαχωρισμό μικρών υπομικροσκοπικών σωματιδίων. Διαχωρίζει μικρά σωματίδια όπως ιούς, ιικά σωματίδια, σύμπλοκα πρωτεϊνών, πρωτεΐνες, λιποπρωτεΐνες, RNA και πλασμιδικό DNA. Μια προπαρασκευαστική φυγόκεντρος Beckman-Coulter με το ρότορά της μέσα φαίνεται στο σχήμα 1.

Εικόνα 1:  Προπαρασκευαστική φυγόκεντρος Beckman-Coulter

Η προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί ως μέθοδος φυγοκέντρησης με κλίση πυκνότητας . Η βαθμίδα σακχαρόζης μπορεί να χρησιμοποιηθεί για τον διαχωρισμό κυτταρικών οργανιδίων. Η βαθμίδα καισίου μπορεί να χρησιμοποιηθεί για τον διαχωρισμό των νουκλεϊκών οξέων.

Τι είναι η Analytical Centrifugation

Η αναλυτική φυγοκέντρηση αναφέρεται σε φυγόκεντρο υψηλής ταχύτητας που χρησιμοποιείται στις αναλυτικές διαδικασίες. Χρησιμοποιείται για τη λήψη πληροφοριών σχετικά με τους τύπους μορίων σε ένα συγκεκριμένο δείγμα γνωρίζοντας το συνολικό σχήμα, τις διαμορφωτικές αλλαγές και τη στοιχειομετρία των υπομονάδων. Μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί για τον προσδιορισμό του ρυθμού καθίζησης των σωματιδίων. Μια υπερφυγόκεντρος φαίνεται στο σχήμα 2.

Εικόνα 2:Υπερφυγόκεντρος Beckman Coulter Optima LE-80K

Ένα σύστημα οπτικής ανίχνευσης παρέχεται με την αναλυτική φυγόκεντρο για την παρακολούθηση της περιστροφής του δείγματος σε πραγματικό χρόνο. Τα πειράματα ταχύτητας καθίζησης και τα πειράματα ισορροπίας καθίζησης είναι οι δύο κύριοι τύποι πειραμάτων που εκτελούνται με αναλυτική φυγοκέντρηση.

Ομοιότητες μεταξύ προπαρασκευαστικής και αναλυτικής φυγοκέντρησης

• Τόσο η προπαρασκευαστική όσο και η αναλυτική φυγοκέντρηση είναι τύποι μεθόδων υπερφυγοκέντρησης που λειτουργούν σε υψηλές ταχύτητες όπως 1 000 000 g.
• Τόσο η προπαρασκευαστική όσο και η αναλυτική φυγοκέντρηση χρησιμοποιούνται για τον διαχωρισμό μικρών σωματιδίων.

Διαφορά μεταξύ προπαρασκευαστικής και αναλυτικής φυγοκέντρησης

Ορισμός

Προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση: Η προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση αναφέρεται σε μια φυγόκεντρο υψηλής ταχύτητας που χρησιμοποιείται για το διαχωρισμό μικρών υπομικροσκοπικών σωματιδίων.

Αναλυτική φυγοκέντρηση: Η αναλυτική φυγοκέντρηση αναφέρεται σε μια φυγόκεντρο υψηλής ταχύτητας που χρησιμοποιείται στις αναλυτικές διαδικασίες.

Αναλυτικές διαδικασίες

Προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση: Η προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση δεν μπορεί να χρησιμοποιηθεί σε αναλυτικές διαδικασίες.

Αναλυτική φυγοκέντρηση: Η αναλυτική φυγοκέντρηση χρησιμοποιείται σε αναλυτικές διαδικασίες.

Τύπος δειγμάτων

Προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση: Η προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση χρησιμοποιείται για τη δημιουργία σφαιριδίων μικρών υλικών όπως μεμβρανών, οργανιδίων, ιών, πλασμιδικού DNA και RNA.

Αναλυτική φυγοκέντρηση: Η αναλυτική φυγοκέντρηση χρησιμοποιείται για τον προσδιορισμό της μάζας και του σχήματος των μακρομορίων, όπως τα συμπλέγματα πρωτεϊνών και ο ρυθμός καθίζησης των μορίων.

Τόμος δείγματος

Προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση: Ένα μεγάλο μέγεθος δείγματος μπορεί να υποβληθεί σε επεξεργασία σε προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση.

Αναλυτική φυγοκέντρηση: Μόνο μικροί όγκοι δειγμάτων (λιγότερο από 1 mL) μπορούν να υποβληθούν σε επεξεργασία με αναλυτική φυγοκέντρηση.

Καθαρότητα του δείγματος

Προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση: Λιγότερο καθαρά δείγματα μπορούν να χρησιμοποιηθούν στην προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση.

Αναλυτική φυγοκέντρηση: Στην αναλυτική φυγοκέντρηση χρησιμοποιούνται σχετικά καθαρά δείγματα.

Συντελεστής καθίζησης και μοριακό βάρος

Προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση: Η προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση μπορεί να χρησιμοποιηθεί για τον προσδιορισμό του συντελεστή καθίζησης και του μοριακού βάρους.

Αναλυτική φυγοκέντρηση: Ένας ακριβής συντελεστής καθίζησης και μοριακό βάρος χρησιμοποιούνται στην αναλυτική φυγοκέντρηση.

Οπτική ανάγνωση

Προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση: Τα κλάσματα μπορούν να συλλεχθούν μετά την εκτέλεση σε προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση και δεν υπάρχει οπτική ανάγνωση κατά τη διάρκεια της εκτέλεσης.

Αναλυτική φυγοκέντρηση: Η πρόοδος της αναλυτικής φυγοκέντρησης μπορεί να παρατηρηθεί οπτικά κατά τη διάρκεια της αναλυτικής φυγοκέντρησης.

Διατάξεις ψύξης

Προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση: Δεν χρησιμοποιούνται διατάξεις ψύξης στην προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση.

Αναλυτική φυγοκέντρηση: Καθώς η υψηλή ταχύτητα παράγει περισσότερη θερμότητα, θα πρέπει να χρησιμοποιηθεί μια διάταξη ψύξης στην αναλυτική φυγοκέντρηση

Τύπος μηχανών

Προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση: Τα L5-65 και L5-75 χρησιμοποιούνται στην προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση.

Αναλυτική φυγοκέντρηση: Το Beckman Model E χρησιμοποιείται στην αναλυτική φυγοκέντρηση.

Συμπέρασμα

Η προπαρασκευαστική και η αναλυτική φυγοκέντρηση είναι οι δύο τύποι μεθόδων υπερφυγοκέντρησης που χρησιμοποιούν φυγοκέντρηση υψηλής ταχύτητας. Η προπαρασκευαστική φυγοκέντρηση χρησιμοποιείται για τον διαχωρισμό μικρών σωματιδίων όπως ριβοσώματα, πλασμιδικό DNA και RNA. Ωστόσο, η αναλυτική φυγοκέντρηση χρησιμοποιείται κυρίως για τη λήψη αναλυτικών μετρήσεων του δείγματος. Η κύρια διαφορά μεταξύ της προπαρασκευαστικής και της αναλυτικής φυγοκέντρησης είναι ο σκοπός κάθε τύπου φυγοκέντρησης κατά την επεξεργασία του δείγματος.

Αναφορά:

1. Aswathi K S, Φοιτητής στο κεντρικό πανεπιστήμιο της Κεράλα Ακολουθήστε. «Υπερφυγοκέντρηση». LinkedIn SlideShare , 17 Νοεμβρίου 2015, Διαθέσιμο εδώ.

Εικόνα Ευγενική προσφορά:

1. «Beckman-Coulter preparative centrifuge Avanti J25-03» Με πραγματικό όνομα:Matylda Sękpl.wiki:Cygaretkacommons:Cygaretka – Ίδιο έργο (CC BY-SA 3.0) μέσω Commons Wikimedia
2. «Ultracentrifuge at359B5y» Αγγλικά Wikibooks (CC BY-SA 2.5) μέσω Commons Wikimedia