Ο νέος διακομιστής προεκτύπωσης στοχεύει να γίνει βιολόγος Απάντηση σε φυσικούς arXiv

Ένα γνωστό ερευνητικό εργαστήριο ρίχνει το βάρος του πίσω από μια ιδέα που ορισμένοι βιολόγοι λένε ότι είναι ώριμη για τον τομέα τους:έναν δωρεάν ιστότοπο που θα δημοσιεύει ακατέργαστα χειρόγραφα στο διαδίκτυο πριν αυτά υποβληθούν σε περιοδικό.

BioRxiv , που κυκλοφόρησε χθες από το μη κερδοσκοπικό Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL), στοχεύει να είναι η έκδοση βιολόγων του arXiv, του δημοφιλούς διακομιστή προεκτύπωσης όπου οι φυσικοί μοιράζονται τα πρόχειρα χειρόγραφά τους για περισσότερα από 20 χρόνια. Ο στόχος είναι να επιταχυνθεί η διάδοση της έρευνας και να δοθεί στους επιστήμονες ένας τρόπος να λάβουν σχόλια για τις εργασίες τους προτού υποβληθούν σε επίσημη αξιολόγηση από ομοτίμους, λέει ο John Inglis, εκτελεστικός διευθυντής του CSHL Press. "Υπάρχει μια αυξανόμενη επιθυμία στην κοινότητα για αυτού του είδους τις υπηρεσίες", λέει ο Inglis.

Θα είναι δωρεάν να υποβάλετε μια εργασία ή να τη διαβάσετε στο bioRxiv, λέει ο Inglis. Η CSHL πληρώνει το κόστος της υπηρεσίας (αρνείται να τα προσδιορίσει) αλλά ελπίζει ότι, όπως και το arXiv, θα προσελκύσει τελικά συνεισφορές. Αν και οποιοσδήποτε μπορεί να υποβάλει μια εργασία, δεν θα αναρτηθούν όλα:Μια ομάδα περισσότερων από 40 «συνεργαζόμενων» επιστημόνων συμφώνησε να εξετάσει τις υποβολές για να «μας διαβεβαιώσει ότι αυτή είναι πραγματική επιστήμη», λέει ο Inglis. "Σίγουρα δεν θέλουμε να βυθιστεί η επιχείρηση δημοσιεύοντας ένα σωρό χάλια."

Ένας άλλος περιορισμός είναι ότι το bioRxiv είναι για τις επιστήμες της ζωής, όχι για την ιατρική, επομένως δεν θα δημοσιεύει κλινικές δοκιμές ή άλλη έρευνα που είναι «ιατρικά σχετική», λέει ο Inglis. Ωστόσο, θα μπορούσαν να δημοσιευτούν ανθρώπινα γενετικά δεδομένα.

Ο ιστότοπος κάνει το ντεμπούτο του με μια χούφτα χαρτιά και μερικά ασυνήθιστα χαρακτηριστικά. Για παράδειγμα, οι συμμετέχοντες όχι μόνο θα προσθέσουν ετικέτα στην εργασία τους με το επιστημονικό πεδίο, αλλά θα πρέπει επίσης να το επισημάνουν ως "Νέα αποτελέσματα", "Επιβεβαιωτικά αποτελέσματα" ή "Αντιφατικά αποτελέσματα", ανάλογα με το αν πρόκειται για πρόοδο ή επιβεβαιώνει ή έρχεται σε αντίθεση με προηγούμενα πειράματα . Οι ερευνητές μπορούν να δημοσιεύσουν αναθεωρημένες εκδόσεις της εργασίας και να προσθέσουν συνδέσμους στη δημοσιευμένη εργασία.

Το BioRxiv δεν είναι μια νέα ιδέα. Πριν από δεκατέσσερα χρόνια, ο τότε διευθυντής των Εθνικών Ινστιτούτων Υγείας (NIH) Χάρολντ Βάρμους πρότεινε έναν διακομιστή προεκτύπωσης για εργασίες βιολογίας. Οι επικριτές το κατέρριψαν για πολλούς λόγους, συμπεριλαμβανομένης της δυσφορίας με την κυβέρνηση που φιλοξενεί ένα τέτοιο αποθετήριο. (Η ιδέα, ωστόσο, οδήγησε στο PubMed Central , αρχείο NIH με δημοσιευμένα χειρόγραφα πλήρους κειμένου.)

Τελικά εμφανίστηκαν διακομιστές προεκτύπωσης που στόχευαν στη βιολογία, συμπεριλαμβανομένων των Nature Precedings . Δημοσίευσε χιλιάδες χειρόγραφα σε διάστημα 5 ετών, αλλά έκλεισε πέρυσι επειδή έγινε «μη βιώσιμο», σύμφωνα με το περιοδικό. Η Δημόσια Βιβλιοθήκη Επιστημών έκανε μια προσπάθεια προεκτύπωσης πριν από 4 χρόνια με το PLOS Currents:Influenza, αλλά προφανώς μεταμορφώθηκε σε ημερολόγιο με κριτές . Οι πιο πρόσφατες προσπάθειες περιλαμβάνουν PeerJ PrePrints και Έρευνα F1000; ο τελευταίος ιστότοπος οργανώνει ανοιχτή αξιολόγηση από ομοτίμους του χαρτιού και χρεώνει ένα τέλος.

Οι σκεπτικιστές έχουν επισημάνει ότι η κουλτούρα της βιολογίας είναι διαφορετική από τη φυσική - οι βιολόγοι συχνά διστάζουν να μοιραστούν τα αποτελέσματά τους μέχρι να επικυρωθούν μέσω της αξιολόγησης από ομοτίμους. Μια άλλη ανησυχία είναι ότι ορισμένα περιοδικά μπορεί να απορρίψουν χειρόγραφα που έχουν ήδη κοινοποιηθεί δημόσια. Αλλά εξαρτάται από το ημερολόγιο. Πανεπιστήμιο της Καλιφόρνια, Λος Άντζελες, ο γενετιστής Leonid Kruglyak, σύμβουλος του bioRxiv, διατηρεί μια λίστα με πολιτικές περιοδικών στη Wikipedia . (Φύση επιτρέπει την προεκτύπωση απόσπασης. Επιστήμη κάνει σε ορισμένες περιπτώσεις? τα περισσότερα κελιά τα περιοδικά όχι.)

Η 15μελής συμβουλευτική επιτροπή του BioRxiv περιλαμβάνει ορισμένα εξέχοντα ονόματα, όπως ο δημιουργός του arXiv, Paul Ginsparg και ο Anurag Acharya, συνιδρυτής του Google Scholar. Ο Kruglyak λέει ότι ο ιστότοπος έχει καλή επιτυχία, επειδή οι προεκτυπώσεις βιολογίας πιάνουν. Τα τελευταία δύο χρόνια, πολλοί ποσοτικοί βιολόγοι έχουν στείλει προεκτυπώσεις στο arXiv, σημειώνει ο Kruglyak. Αλλά αυτό το αποθετήριο «δεν έχει σχεδιαστεί για να απευθύνεται στους βιολόγους ευρύτερα» και δεν μπορούσε να χειριστεί όλα τα έγγραφα τους, λέει. Οι δυνατότητες σχολιασμού του BioRxiv θα το ξεχωρίσουν επίσης από το arXiv.

Ο Inglis είναι λίγο πιο προσεκτικός:«Σίγουρα συνειδητοποιούμε ότι μπορεί να απαιτηθούν πολιτιστικές αλλαγές», λέει. Εάν οι επιστήμονες δεν ενδιαφέρονται, προσθέτει, "θα έχουμε μάθει κάτι."